王凯、彭昱畅、欧豪等人主演的40集谍战剧《交锋》终于迎来了高潮和结局。腾讯视频提前更新了最后六集，让观众一同见证这场持续多年的隐秘战争的收尾。尽管剧中关于金丽娜的剧情曾受到吐槽，但最终几集的节奏却显著加快，频频反转让许多角色的结局完全出乎意料。马憩从未背叛国安，他的辞职实际上是为了布局，让同事们对他产生疑虑和误解，从而顺利渗透敌方。他脱离国安体系本是为了减少对方的戒备，进而成功进入郑桂平与朱应甲的核心圈子。
马憩会见朱应甲实际上是一个诱饵，真正的目标是郑桂平。最初，郑桂平对马憩的叛变持怀疑态度，而朱应甲假装身体不适，与郑桂平一起策划，以便揭露藏在自己组内的内奸。为了促成这一计划，郑桂平故意流出风声，给陈乐园以接班的机会，陈乐园也因此自信满满，甚至对朱应甲进行羞辱。
然而，深藏敌方心脏的我方卧底礼卿在关键时刻被捕。他伪装成其他任务回到大陆，见到了即将退休的吴声来，原来吴声来正是整个布局的幕后推手。马憩辞职成卧底，礼卿偷窥名单，随即朱应甲开始排查内鬼，整个过程都在吴声来的掌控之中。
马憩回到大陆后，国安局的抓捕行动全面启动，依据礼卿提供的名单，朱应甲手下的重要人物温宗树和夏姐团伙相继落网。被捕的夏姐选择坦白交待，然而敌方特工贾春霖则长期为敌方传递情报，最终也未能逃脱国安的法网。与此同时，林看山被抓，何春晓成功破解林看山的密码本，获得了他多年来间谍活动的全部证据。林在文化交流会结束后主动与何春晓握手，似乎已做好被捕的准备，如释重负，不再害怕暴露。
林看山在大陆潜伏多年，心中始终惦念着故土。在被捕后，他主动坦白了潜伏已久的绝密计划：在机场周围秘密修建的地道网络，一旦台海局势恶化，便可引爆炸药，造成重大破坏。最终，林看山打破了朱应甲最深藏的阴谋，因为他意识到，随着陈乐园的上位，作为朱的旧部，自己回去未必会有好下场。
林看山也与自己的姑婆重逢，虽她年岁已高却记不得往事，林的内心被触动。此时，他关于金丽娜的情感也开始变得复杂。在被捕之前，林看山留下了一封信和一笔钱给金丽娜，希望她能治病并远离纷争。与林看山一同被捕的还有马憩，进行了一系列的假戏真做，以便让对方相信他的身份。
最终，双方启动了换人计划。在经过激烈的谈判博弈后，决定以礼卿作为交易筹码交换林看山。林看山被送回台湾，而礼卿安全抵达大陆。这位隐秘多年的卧底终于有了一个好结局，得以全身而退。林回到台湾后虽失去利用价值，却不断被噩梦笼罩。郑桂平十分重视马憩，与林的交换也让他向陈乐园承诺正在全力营救马憩，而国安局则故意放任这些事情的进展，为的正是让马憩能够继续在内部卧底。
吴声来也正式退休，魏广进接管国安局，成为马憩的新联络人。与此同时，长久以来的操盘手朱应甲却彻底覆灭，他经营的间谍网络被一一摧毁。林看山的计划出乎意料，马憩的身份也让人难以捉摸，两个棋子的失控使得朱应甲遭遇重大挫折。最令人震惊的结局是，所有人都没有因战斗而殒命，曾被认为已经死去的人依旧活着。原来谢晓舟和黄子燕皆是国安局安排的假死，而林看山也平安回来。最后一幕中，蒋在珍的身影出现，让人意外地发现她原来并未死去。
此外，马憩有一个开放式的结局，郑桂平利用关系设法救出马憩，使他成功渗透进军情局。朱应甲退位后，无法掌控实权的陈乐园难以坐稳。马憩在内部的行动等同于掌握了对方的核心机密。他依旧潜伏，何春晓在人群中偶然看见马憩对自己微笑，接着他便消失在拥挤的人潮中，那一刻春晓似乎才真正理解，马憩就是那位隐形战线上的无名英雄。